Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms