Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms