Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MSX1P28360 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MSX1P28360 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MSX1P28360 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MSX1P28360 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MSX1P28360 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MSX1P28360 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MSX1P28360 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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