Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTAFRP25105 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms