Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
VAMP1P23763 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms