Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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