Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms