Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms