Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL3O43909 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms