Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms