Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COCHO43405 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COCHO43405 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms