Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms