Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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RABGEF1Q9UJ41 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1Q9UJ41 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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