Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD1Q9UIS9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD1Q9UIS9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms