Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms