Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK-5Q9HDB9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms