Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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