Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SMIM3Q9BZL3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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