Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms