Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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