Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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