Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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