Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms