Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms