Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.4 ms