Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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