Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM46DQ8NEK8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM46DQ8NEK8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms