Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECW1Q76N89 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms