Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms