Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms