Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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