Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC27A3Q5K4L6 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms