Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA3Q53S33 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms