Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PROX2Q3B8N5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms