Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALX1Q15699 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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