Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYTH1Q15438 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms