Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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UBE3CQ15386 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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UBE3CQ15386 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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UBE3CQ15386 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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