Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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