Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAM2Q15035 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms