Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIN2CQ14957 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms