Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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