Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GBX1Q14549 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms