Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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