Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A3Q14050 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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