Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RASGRF1Q13972 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms