Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4BQ13620 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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