Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms