Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SGCGQ13326 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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SGCGQ13326 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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SGCGQ13326 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SGCGQ13326 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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SGCGQ13326 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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SGCGQ13326 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCGQ13326 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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