Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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