Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CALCOCO2Q13137 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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